Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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