Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms