Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms