Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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