Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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H2-M5A7VMS3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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