Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms