Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vstm4T1NXB5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm4T1NXB5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm4T1NXB5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm4T1NXB5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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