Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lgr5Q9Z1P4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lgr5Q9Z1P4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lgr5Q9Z1P4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lgr5Q9Z1P4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lgr5Q9Z1P4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lgr5Q9Z1P4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lgr5Q9Z1P4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lgr5Q9Z1P4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lgr5Q9Z1P4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lgr5Q9Z1P4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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