Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

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Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Vav3Q9R0C8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vav3Q9R0C8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vav3Q9R0C8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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