Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ercc4Q9QZD4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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