Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms