Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nectin3Q9JLB9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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