Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clstn1Q9EPL2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms