Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp2aQ9DB34 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms