Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms