Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms