Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spns3Q9D232 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms