Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pfdn1Q9CWM4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pfdn1Q9CWM4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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