Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms