Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms