Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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