Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek8Q91ZR4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Nek8Q91ZR4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek8Q91ZR4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms