Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ercc8Q8CFD5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ercc8Q8CFD5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ercc8Q8CFD5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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