Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc113Q8C5T8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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