Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms