Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms