Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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Ccdc18Q640L5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Ccdc18Q640L5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Ccdc18Q640L5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ccdc18Q640L5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ccdc18Q640L5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ccdc18Q640L5 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Ccdc18Q640L5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Ccdc18Q640L5 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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