Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms