Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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