Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms