Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms