Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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