Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms