Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RhobP62746 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RhobP62746 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RhobP62746 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RhobP62746 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
RhobP62746 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RhobP62746 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RhobP62746 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms