Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms