Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms