Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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