Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ItgavP43406 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms