Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtbP41155 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtbP41155 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtbP41155 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtbP41155 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms