Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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