Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms