Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms