Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms