Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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