Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ctnnd2O35927 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctnnd2O35927 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms