Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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