Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms