Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc146E9Q9F7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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