Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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