Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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